Похоже, дрожжи как-то умудряются выбираться до следующего добавления. Проверь температуру – если слишком низкая, они могут осесть на дно. Загляни на pH, если слишком кислый – убьёт их. И убедись, что в браге нет посторонних микроорганизмов, которые вытесняют дрожжи. Иногда даже немного сахара или изменение гравитации может вытянуть их из суспензии. Следи за этими параметрами, и увидишь, где прячутся пропавшие клетки.