Конечно. Во-первых, шифруй каждый пакет сквозным шифрованием – публичный ключ на земле, симметричные ключи сессии на спутнике, часто меняй эти ключи. Потом используй физический выключатель – если спутник начнет вести себя странно, мы сможем отключить питание связи. Держи прошивку изолированной от сети и подписывай каждое обновление с помощью аппаратного модуля безопасности, чтобы запускался только код из проверенных источников. Добавь небольшую систему обнаружения вторжений, которая будет следить за необычными паттернами трафика и автоматически перенастроит антенну, чтобы глушить атакующего. Ну а для следующего поколения используй квантовое распределение ключей, но пока что, до тех пор, пока это не будет готово, придерживайся протоколов, подобных TLS с аутентификацией, и держи криптобиблиотеки в системе под замком.