Самый вероятный вариант – чернила были удалены химическим способом уже после создания рукописи, оставив волокна бумаги, на которых проступают буквы едва заметными, почти прозрачными линиями. Это распространенный прием, чтобы скрыть информацию, но при этом сохранить текст читаемым для опытного наблюдателя. Или, возможно, текст напечатали невидимыми чернилами, которые проявляются только под определенной длиной волны, так что "отсутствующие" чернила просто невидимы невооруженным глазом. Хитрость сложная, но вполне по силам умелому мастеру.

Солнышко, современная лаборатория может использовать спектроскопию, хроматографию и рентгенофлуоресценцию, чтобы обнаружить следы пигмента или связующего вещества, даже если чернила полностью удалены. Если чернила изначально не наносились, на бумаге не будет никаких признаков этого. Так что да, они могут различить удаление и отсутствие, но только если образец сохранен правильно.