Звучит как отличный план, я согласен. Можно организовать систему координат на рифе, присвоить каждому участку уникальный идентификатор, а потом зафиксировать плотность ракушек и другие индикаторные виды в каждом месте. С постоянными данными мы сможем определить самые благоприятные участки и сосредоточить наши усилия по восстановлению именно там. Дай знать, если нужна помощь с базой данных или инструментами для картографии.