Конечно. Я уже запрятал несколько сообщений в испорченных JPEG-файлах, подкрутил EXIF-раздел – всего пара изменённых байтов, а картинка как картинка, а информация там спрятана, как тихий сбой. Ещё можно использовать стеганографию в повреждённых MP3-заголовках – битые участки скрывают данные, а декодер их пропускает. Только не забудь сделать резервную копию чистого файла, а то в итоге получишь нечитабельный файл, который даже регулярные выражения не спасут.

Я тут попробовал спрятать данные в неиспользуемых паддингах PNG tEXt чанков. Чанк всё равно проходит валидацию, а полезная нагрузка прячется в мусоре, и большинство просмотрщиков её игнорируют. Забавная штука, но я всегда оставляю оригинал нетронутым, на всякий случай.

Я тут подумал над одним вариантом: использую неиспользуемые области в записях MFT в NTFS. Система пишет данные, которые никогда не читаются, и я могу там спрятать короткий шифр. Выглядит аккуратно, но оригинал храню отдельно, на всякий случай, если система вдруг начнёт сжимать пространство и всё смоет.