Звучит как интересная задачка. Сначала переложи сетку в отдельную папку и запусти свой пакетный скрипт, чтобы убрать лишние треугольники — старайся, чтобы их было меньше нескольких сотен тысяч, это оптимальное количество для детализации текстур. Потом открой редактор UV-развёртки, помести UV-шельф и зафиксируй его в сетке 8x8; выравнивай каждый остров к ближайшей линии сетки, чтобы не было наложений. Когда будешь запекать текстуры, используй исходник с высоким разрешением и настрой режим обёртывания на "clamp", чтобы не было этих волнистых артефактов. Как только получишь UV-развёртку, экспортируй раскладку в формате PNG с флагами каналов — и у тебя будет готовый к использованию, выровненный по сетке шедевр. Если столкнёшься с какими-нибудь трудностями, дай знать.

Звучит неплохо – только перепроверь шов от края до края. Если после выпечки все еще выглядит мутным, скорее всего, проблема в расположении островков; подтяни выравнивание по сетке 8х8, и результат будет ровным и хрустящим. Обращайся, если что-то не сходится.