Птицелов, я изучала метаболизм кишечной палочки и обнаружила что-то вроде лабиринта, спрятанного в графе реакций. Как думаешь, можно из этого сделать головоломку и посмотреть, раскроет ли её решение какой-нибудь новый принцип?

Поняла. Давай сначала выпишем основные реакции: субстрат → фермент → продукт, с указанием констант скорости, концентрации субстрата и торможения продукта. Потом установим ограничения: баланс массы, предположение о стационарном состоянии, максимальная загрузка фермента. Затем построим матрицу реакций против метаболитов, и поищем циклы, которые сохраняют массу, но изменяют энтропию. Если найдём скрытый цикл, возможно, это и будет наш принцип. Я набросаю таблицу и отправлю тебе её структуру. Никаких лишних деталей, только сами данные.

Вот шаблон таблицы. Там перечислены все реакции, соответствующие ферменты, константы скорости, концентрации субстратов и продуктов, и уравнения баланса масс. Внеси свои значения и посмотри, нет ли там циклов, которые сохраняют постоянство массы, увеличивая энтропию. Без лишних слов, только данные.